# Build a large "drawn" mind map as a vector SVG (zoomable) for
# "Trascrizione negli eucarioti", fully in Italian, based on the user's text.

import math
from textwrap import wrap

W, H = 2400, 1600  # canvas size (px)

# Basic SVG helpers
def svg_header(w, h):
    return f'''<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="{w}" height="{h}" viewBox="0 0 {w} {h}" >
  <defs>
    <style>
      .title {{ font: 700 28px/1.2 ui-sans-serif, -apple-system, Segoe UI, Roboto, Helvetica, Arial; fill:#111; }}
      .text {{ font: 400 22px/1.35 ui-sans-serif, -apple-system, Segoe UI, Roboto, Helvetica, Arial; fill:#222; }}
      .small {{ font: 400 20px/1.35 ui-sans-serif, -apple-system, Segoe UI, Roboto, Helvetica, Arial; fill:#333; }}
      .center {{ font: 800 42px/1.2 ui-sans-serif, -apple-system, Segoe UI, Roboto, Helvetica, Arial; fill:#0b0b0b; }}
    </style>
    <filter id="shadow" x="-20%" y="-20%" width="140%" height="140%">
      <feDropShadow dx="0" dy="2" stdDeviation="2" flood-color="#000000" flood-opacity="0.15"/>
    </filter>
  </defs>
  <rect x="0" y="0" width="{w}" height="{h}" fill="#ffffff"/>
'''
def svg_footer():
    return '</svg>\n'

def draw_box(x, y, w, h, title, body_lines, rx=20, ry=20):
    # Rounded rect + title + body
    # Apply a subtle shadow
    rect = f'<rect x="{x}" y="{y}" width="{w}" height="{h}" rx="{rx}" ry="{ry}" fill="#fafafa" stroke="#d0d0d0" stroke-width="2" filter="url(#shadow)"/>\n'
    # Title
    tx = x + 18
    ty = y + 38
    t = f'<text x="{tx}" y="{ty}" class="title">{title}</text>\n'
    # Body
    lines = []
    cur_y = ty + 24
    for line in body_lines:
        lines.append(f'<text x="{tx}" y="{cur_y}" class="small">• {line}</text>')
        cur_y += 26
    return rect + t + "\n".join(lines) + "\n"

def multiline(text, width=54):
    # Wrap preserving short bullets
    out = []
    for paragraph in text.split("\n"):
        paragraph = paragraph.strip()
        if not paragraph:
            out.append("")
        else:
            out.extend(wrap(paragraph, width=width))
    return out

def draw_connector(x1, y1, x2, y2):
    # Smooth cubic bezier between (x1,y1) and (x2,y2)
    dx = (x2 - x1) * 0.5
    c1x, c1y = x1 + dx, y1
    c2x, c2y = x2 - dx, y2
    return f'<path d="M {x1} {y1} C {c1x} {c1y}, {c2x} {c2y}, {x2} {y2}" fill="none" stroke="#444" stroke-width="2"/>\n'

svg = [svg_header(W, H)]

# Center node
cx, cy = W//2, H//2
center_w, center_h = 520, 160
center_x, center_y = cx - center_w//2, cy - center_h//2
svg.append(f'<rect x="{center_x}" y="{center_y}" width="{center_w}" height="{center_h}" rx="26" ry="26" fill="#f0f3f7" stroke="#b6c2d0" stroke-width="3" filter="url(#shadow)"/>')
svg.append(f'<text x="{cx}" y="{cy-10}" text-anchor="middle" class="center">Trascrizione negli eucarioti</text>')
svg.append(f'<text x="{cx}" y="{cy+30}" text-anchor="middle" class="text">maggior complessità: polimerasi, fattori, promotori, regolazione</text>')

# Predefine nodes (title, body lines, target position)
nodes = []

# 1. RNA Polimerasi
nodes.append({
    "title":"RNA polimerasi (Pol I, II, III)",
    "body": multiline(
        "Pol I — nucleolo; precursore 45S → 18S, 28S, 5,8S; promotore: core (-35→+15), upstream (-150→-50), variabile tra specie.\n"
        "Pol II — mRNA; snRNA (magg.); miRNA (18–25 nt). GTF: TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH, TFIIJ. Promotori: TATA (−30/−25), spesso CAAT (~−80), enhancer (50–100 nt; fino a >−1000; fino a ~100×). Promotori TATA-less: riconosciuti da TFIID.\n"
        "Pol III — rRNA 5S, tRNA, alcuni snRNA, scRNA SRP; promotori intragenici; assenti TATA/CAAT."
    , 62),
    "x": 140, "y": 120, "w": 700, "h": 360
})

# 2. Piccoli RNA
nodes.append({
    "title":"Piccoli RNA (sRNA)",
    "body": multiline(
        "snRNA — splicing; formano snRNP con proteine; per lo più da Pol II, alcuni da Pol III.\n"
        "snoRNA — maturazione rRNA; generati da Pol II come risultato dello splicing.\n"
        "scRNA — SRP (Signal Recognition Particle), trascritto da Pol III.\n"
        "miRNA — 18–25 nt; regolazione dell’espressione genica (degradazione/traslazione); trascritti soprattutto da Pol II."
    , 60),
    "x": 1560, "y": 110, "w": 680, "h": 300
})

# 3. Fattori generali di trascrizione / Assemblaggio
nodes.append({
    "title":"GTF & Assemblaggio Pol II",
    "body": multiline(
        "TFIID = TBP + 8–12 TAF; TBP riconosce TATA box.\n"
        "Sequenza classica: TFIID → TFIIA → TFIIB (lega attivatori/coattivatori; DNA bending) → TFIIE/F, TFIIH, TFIIJ + core Pol II → apertura DNA + inizio con idrolisi di ATP.\n"
        "Modello alternativo: TFIID–TFIIA + il resto della Pol II in un’unica tappa."
    , 62),
    "x": 130, "y": 540, "w": 740, "h": 280
})

# 4. Promotori e sequenze
nodes.append({
    "title":"Promotori & sequenze regolatrici",
    "body": multiline(
        "Pol I — elemento core (-35→+15) + upstream (-150→-50).\n"
        "Pol II — TATA (−30/−25), spesso CAAT (~−80); enhancer 50–100 nt fino a >−1000 basi; ↑ efficienza fino a ~100×; esistono TATA-less (riconosciuti da TFIID).\n"
        "Pol III — promotori intragenici (interni), senza TATA/CAAT."
    , 64),
    "x": 980, "y": 120, "w": 500, "h": 300
})

# 5. Regolazione combinatoria
nodes.append({
    "title":"Regolazione combinatoria",
    "body": multiline(
        "Attivatori: recettori steroidei su SRE; fattore AP1.\n"
        "Coattivatori: CBP (CREB-binding protein) collega TFIIB all’attivatore.\n"
        "Via cAMP: stimolo → ↑ cAMP → CREB → CRE su DNA → recluta CBP → induzione trascrizionale.\n"
        "Esempio: gene GnRH con elementi SRE + AP1 a monte del promotore."
    , 62),
    "x": 1560, "y": 460, "w": 680, "h": 280
})

# 6. Allungamento
nodes.append({
    "title":"Elongazione",
    "body": multiline(
        "Dopo l’avvio, le RNA polimerasi eucariotiche procedono senza interruzione aggiungendo ribonucleosidi trifosfati (rNTP) al trascritto nascente."
    , 68),
    "x": 980, "y": 470, "w": 500, "h": 160
})

# 7. Terminazione Pol II
nodes.append({
    "title":"Terminazione (Pol II)",
    "body": multiline(
        "Avviene a valle del sito di poliadenilazione. Il CTD della Pol II coordina fattori di taglio (cleavage) e poliadenilazione → rilascio dell’mRNA poliadenilato (maturo). La porzione residua è degradata da Rat1. In alcuni casi: ipotesi di ruolo catalitico dell’RNA stesso (ribozima)."
    , 62),
    "x": 980, "y": 670, "w": 500, "h": 220
})

# 8. Confronto procarioti
nodes.append({
    "title":"Procarioti vs Eucarioti",
    "body": multiline(
        "Procarioti: una sola RNA polimerasi; mRNA spesso policistronici (più geni, unica funzione). "
        "Eucarioti: tre polimerasi; promotori complessi (TATA, CAAT, enhancer); regolazione combinatoria; trascritti in genere monocistronici (un gene → un prodotto)."
    , 64),
    "x": 1560, "y": 770, "w": 680, "h": 220
})

# 9. Glossario / Terminologia essenziale
nodes.append({
    "title":"Glossario essenziale",
    "body": multiline(
        "TATA box — sequenza ricca in A/T a −30/−25 per Pol II; riconosciuta da TBP.\n"
        "CAAT box — regione regolatrice tipica (~−80).\n"
        "Enhancer — 50–100 nt; anche molto distanti (>−1000); ↑ fino a ~100×.\n"
        "TFIID — complesso TBP + 8–12 TAF.\n"
        "snRNP — complessi snRNA+proteine per lo splicing.\n"
        "CTD — coda C-terminale di Pol II, piattaforma per taglio/poliA.\n"
        "Rat1 — esonucleasi che degrada l’RNA residuo dopo il rilascio dell’mRNA.\n"
        "CRE/CREB/CBP — elementi, fattore e coattivatore nella risposta al cAMP.\n"
        "SRE/AP1 — elementi per recettori steroidei e per il fattore AP1."
    , 62),
    "x": 130, "y": 860, "w": 740, "h": 360
})

# Draw connectors from center to each box (using approximate anchor points)
def anchor_to_center(box):
    # Choose a side of the box closer to the center
    x, y, w, h = box["x"], box["y"], box["w"], box["h"]
    # Determine which side is nearest in terms of Euclidean distance from center
    candidates = [
        (x+w/2, y, "top"),
        (x+w/2, y+h, "bottom"),
        (x, y+h/2, "left"),
        (x+w, y+h/2, "right")
    ]
    # pick the closest point to the center
    px, py, _ = min(candidates, key=lambda p: (p[0]-cx)**2 + (p[1]-cy)**2)
    # choose center box anchor: nearest side
    # center anchors around the edge of the central rectangle
    # We'll connect from central edge towards the node direction
    vx, vy = px - cx, py - cy
    # select edge on center rect (compute intersection with central rect bounds)
    left, right = center_x, center_x + center_w
    top, bottom = center_y, center_y + center_h
    tx, ty = cx, cy  # default
    if abs(vx) > abs(vy):
        # connect horizontally
        if vx > 0:   # to the right
            tx, ty = right, cy
        else:        # to the left
            tx, ty = left, cy
    else:
        # connect vertically
        if vy > 0:   # to the bottom
            tx, ty = cx, bottom
        else:
            tx, ty = cx, top
    return tx, ty, px, py

# Add nodes and connectors
for node in nodes:
    # box drawing
    svg.append(draw_box(node["x"], node["y"], node["w"], node["h"], node["title"], node["body"]))
    # connector
    x1, y1, x2, y2 = anchor_to_center(node)
    svg.append(draw_connector(x1, y1, x2, y2))

# Footer note
svg.append(f'<text x="{W-20}" y="{H-20}" text-anchor="end" class="small" fill="#666">Mappa (SVG) — zooma per leggere tutti i dettagli. Basata sul testo fornito.</text>')

svg.append(svg_footer())

out_path = "/mnt/data/Mappa_Trascrizione_Eucarioti_disegnata.svg"
with open(out_path, "w", encoding="utf-8") as f:
    f.write("".join(svg))

out_path